Análisis de la variabilidad del gen G del virus sincicial respiratorio

Abstract

Antecedentes: El virus sincicial respiratorio (VSR) es un importante patógeno respiratorio. Se clasifica en dos tipos, VSR-A y VSR-B, con base en la secuencia del gen G. A partir de los años 1999 y 2009 empezaron a circular variantes con duplicaciones parciales del gen G de VSR-B y VSR-A, respectivamente. Las medidas de higiene y prevención para evitar la propagación el coronavirus de tipo 2 causante del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) afectó la prevalencia de VSR. Objetivo: Caracterizar las secuencias de VSR circulantes en México y a nivel global antes y durante la pandemia de SARS-CoV-2. Resultados: Se identificaron 154 muestras de estudios epidemiológicos en las que se reportó la detección de VSR. De éstas, se obtuvieron 25 secuencias de buena calidad. Se analizaron un total de 14,818 secuencias, obtenidas de GenBank y GISAID (9,267 de VSR-A y 5,551 de VSR-B), entre las cuales se encontraron 35 reportadas en México. Todas las secuencias (tanto a nivel mundial como en México) detectadas durante la pandemia de SARS-CoV-2 correspondieron a la variante ON1 del genotipo NA1 (VSR-A) y al genotipo BA-CC (VSR-B). Las secuencias de VSRA muestran diversidad tanto a nivel nacional como global, mientras que la mayoría de las secuencias de VSR-B identificadas durante la pandemia se concentran en una clada. Conclusión: Tras la introducción del SARS-CoV-2, los únicos genotipos de VSR que circulan a nivel mundial son la variante ON1 de NA1 y BA-CC. Las secuencias de VSR-A muestran mayor diversidad, mientras que ésta se ha reducido en el caso de VSR-B. Esto sugiere que los factores asociados a la evolución de VSR-B puedan haber diferido de los de VSR-A y se pudiera haber presentado un evento de cuello de botella evolutivo. Se requieren estudios adicionales para corroborar esta posibilidad y analizar los posibles mecanismos que dieron lugar a este comportamiento.