Estudio del comportamiento epidemiológico de virus respiratorios durante dos años de la pandemia por SARS-CoV-2

Abstract

Introducción: La co-circulación de varios patógenos respiratorios tiene como consecuencia casos de coinfecciones entre dos o más patógenos, o una posible interferencia viral. Si bien las medidas de las intervenciones no farmacológicas durante la pandemia se centraron en la prevención de la transmisión del SARS-CoV-2, también alteraron e interrumpieron la circulación de otros patógenos respiratorios. Objetivo: Estudiar el comportamiento epidemiológico de virus respiratorios durante la pandemia de SARS-CoV-2 en San Luis Potosí. Metodología: Se analizaron 2,540 muestras de hisopados nasofaríngeos previamente colectados para la detección clínica de SARS-CoV-2 para detectar, mediante RT-qPCR múltiple, a 22 patógenos respiratorios. Se realizó un muestreo aleatorio estratificado por semana epidemiológica, seleccionando 1,816 muestras negativas y 724 positivas para SARS-CoV-2. Resultados: Se detectaron 781 muestras positivas a SARS-CoV-2 y 106 positivas a patógenos distintos a SARS-CoV-2. En 90 muestras se detectó alguna coinfección, de los cuales, 38 casos estaban coinfectados con SARS-CoV-2 y 9 casos con bacterias. Los casos de influenza y VSR disminuyeron drásticamente, mientras que los casos de HRV/EV prevalecieron a lo largo del periodo pandémico. Después del periodo invernal 2020-2021 no se registraron casos de influenza. La incidencia más alta de SARS-CoV-2 llegó a inicios de 2022, coincidiendo con la cuarta ola de la pandemia y con un drástico descenso en la incidencia de HRV. En el estudio no se detectaron casos de influenza B Yamagata ni HCoV OC43. Conclusiones: La co-circulación de varios patógenos respiratorios podría modificar el comportamiento epidemiológico de los virus respiratorios. Los resultados del presente estudio respaldan la idea de que los HRV y otros virus respiratorios sin envoltura prevalecieron durante la pandemia. Se observó una interferencia viral donde una infección por HRV protege contra SARS-CoV-2, y que el dominio de estos dos virus impediría la circulación de virus como influenza y VSR. La ausencia de casos de influenza B Yamagata apoya la teoría sobre la extinción de este virus alrededor del mundo.