Plasticidad y evolución estructural de moléculas de RNA in silico

Abstract

Biomoléculas como el RNA requieren adoptar determinada conformación para desempeñar cierta actividad. Esto refuerza la idea de que ‘estructura es igual a función’. Sin embargo, estas moléculas en realidad son capaces de adoptar un repertorio de diferentes estructuras. Esta capacidad de adoptar diversos fenotipos, sin que el cambio se deba a una modificación genética, se conoce como plasticidad estructural. Este estudio es motivado por la intuición de que este repertorio de posibles estructuras favorece la capacidad de las moléculas para evolucionar estructuras innovadoras. Estudios previos intentaron modelar este comportamiento, resultando en un estancamiento evolutivo provocado por la aparición de estructuras sumamente robustas, tanto a perturbaciones genéticas como ambientales. Este anómalo resultado se denominó ‘confinamiento neutral’. En este proyecto, me propongo demostrar que moléculas de RNA, simuladas in silico, son capaces de acceder a una estructura específica τ , mediante evolución dirigida, más fácilmente cuando se considera la capacidad de plasticidad estructural. Para lo anterior, utilizo un novedoso modelo basado en la unión RNA-ligando para determinar la adecuación de cada molécula.