https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/2781 2026-07-07T23:44:25Z https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/10028 El RNA no codificante EIN2 modula la respuesta de dos fitohormonas en plantas Nieto Hernández, Jesús Las plantas poseen complejas redes regulatorias que integran diversas señales hormonales, ambientales y del desarrollo para coordinar su crecimiento y su adaptación al ambiente. Entre los componentes de estas redes regulatorias se encuentran los RNAs largos no codificantes (lncRNAs, de sus siglas en inglés), moléculas capaces de modular la expresión génica mediante su interacción con proteínas, otros RNAs o regiones del DNA. A pesar de su creciente caracterización, su origen evolutivo y sus características estructurales en plantas aún han sido poco estudiados. En este trabajo se caracterizaron dos lncRNAs asociados con genes reguladores en Arabidopsis thaliana: el lncRNA localizado río abajo del gen ETHYLENE INSENSITIVE 2 (EIN2) (AT5G03285) y el lncRNA intergénico asociado a TBP2, (TALIR). La caracterización funcional de AT5G03285 mostró que las líneas mutantes knockdown presentan alteraciones en la respuesta al ET, incluido un fenotipo intermedio de triple respuesta y respuestas alteradas a la fitohormona ABA. Asimismo, líneas reporteras del promotor de AT5G03285, revelaron patrones de expresión específico de tejido y de respuesta a hormonas. Los análisis comparativos de sintenia indicaron que el locus de AT5G03285 se encuentra conservado en múltiples especies de plantas, especialmente en angiospermas, manteniendo su proximidad genómica con EIN2. Aunque la conservación nucleotídica es limitada, se identificaron regiones conservadas con pequeños marcos de lectura (sORF), y los análisis de estructura secundaria revelaron estructuras tallo-asa potencialmente implicadas en la interacción RNA-EIN2. Finalmente, TALIR mostró conservación de sintenia dentro del orden Brassicales, así como evidencias de conservación estructural y regulatoria en su región promotora. En conjunto, estos resultados sugieren que los lncRNAs asociados con genes reguladores centrales pueden modular las respuestas hormonales, del desarrollo y de adaptación en plantas.; Plants possess complex regulatory networks that integrate hormonal, environmental, and developmental signals to coordinate growth and adaptation to their environment. Among the components of these regulatory networks are long non-coding RNAs (lncRNAs), molecules capable of modulating gene expression through interactions with proteins, other RNAs or DNA regions. Despite their increasing characterization, the evolutionary origin and structural features of many plant lncRNAs remain poorly understood. In this work, two lncRNAs associated with regulatory genes in Arabidopsis thaliana were characterized: the lncRNA located downstream of the ETHYLENE INSENSITIVE 2 (EIN2) gene (AT5G03285) and the intergenic lncRNA associated with TBP2 (TALIR). Functional characterization of AT5G03285 revealed that knockdown mutant lines exhibit altered ethylene responses, including an intermediate triple-response phenotype and modified responses to the phytohormone ABA. In addition, reporter lines carrying the AT5G03285 promoter revealed tissue-specific expression patterns and regulation in response to hormonal signals. Comparative synteny analyses indicated that the AT5G03285 locus is conserved across multiple plant species, particularly among angiosperms, maintaining its genomic proximity to EIN2. Although overall nucleotide conservation is limited, conserved regions containing small open reading frames (sORFs) were identified, and secondary structure analyses revealed stem–loop structures potentially involved in RNA–EIN2 interactions. Finally, TALIR showed synteny conservation within the order Brassicales, as well as evidence of structural and regulatory conservation in its promoter region. Together, these results suggest that lncRNAs associated with key regulatory genes may play important roles in modulating hormonal signaling, development, and environmental adaptation in plants. 2026-07-03T00:00:00Z https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/10009 Síntesis de nanopartículas de plata con Z-bixina y Z-norbixina y su estudio antibacteriano Chinome Moreno, Carolina La resistencia microbiana es una problemática a nivel mundial, actualmente la Organización Mundial de la Salud (OMS), enlista aquellas cepas que tienen una prioridad en la búsqueda de nuevas alternativas para combatirlas. Los nanomateriales, especialmente las nanopartículas de plata se han convertido en materiales prometedores como antimicrobianos, sin embargo, existe una preocupación por los métodos de síntesis que pueden generar residuos tóxicos, es así que la nanotecnología ha enfocado sus métodos en procesos biológicos, como el uso de extractos vegetales, los cuales no solo cumple funcionan como agentes reductores sino también como agentes estabilizantes. Por lo anterior esta investigación se enfocó en la síntesis de nanopartículas de plata usando apocarotenoides aislados del arilo de la semilla de Bixa orellana, el cual se compone principalmente de un 93% de bixina y un 3% de norbixina. Dichos apocarotenoides tienen una importancia económica en la industria de los colorantes, aportando colores entre el rojo a naranja intenso y amarillo pero adicional han demostrado actividades antimicrobianas, antiparasitarias y antioxidantes. De acuerdo con los resultados, la Z-bixina y la Z-norbixina son agentes reductores y estabilizantes en la síntesis de nanopartículas de plata, generado partículas pseudoesféricas, con tamaños promedio de 23 nm, coloides homogéneos y con actividad antimicrobiana de amplio espectro contra Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli y Staphylococcus aureus, con concentraciones mínimas inhibitorias entre 4 a 32 µg/mL, con mayor efectividad sobre P. aeruginosa. Estos apocarotenoides son agentes reductores eficientes para la síntesis de nanopartículas de plata e incrementan la actividad antimicrobiana de las nanopartículas de plata.; Antimicrobial resistance is a global issue, currently, The World Health Organization (WHO) has identified certain strains as priorities in the search for new ways to combat them. Nanomaterials, especially silver nanoparticles, have emerged as promising antimicrobial agents, however, there is concern about synthesis methods that may generate toxic waste. Consequently, nanotechnology has shifted its focus to biological processes, such as the use of plant extracts, which not only function as reducing agents but also as stabilizing agents. Therefore, this study focused on the synthesis of silver nanoparticles using apocarotenoids isolated from the aryl of Bixa orellana seeds, which consist mainly of 93% bixin and 3% norbixin. These apocarotenoids are economically important in the dye industry, providing colors ranging from red to deep orange and yellow; however, they have also demonstrated antimicrobial, antiparasitic, and antioxidant activities. According to the results, Z-bixin and Z-norbixin are performing as reducing agents and stabilizers in the synthesis of silver nanoparticles, yielding pseudospherical particles with an average size of 23 nm, homogeneous colloids, and broad spectrum antimicrobial activity against Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, and Staphylococcus aureus, with minimum inhibitory concentrations ranging from 4 to 32 µg/mL, showing greater effectiveness against P. aeruginosa. In conclusion, these apocarotenoids are effective reducing agents in the synthesis of silver nanoparticles and achieve and increment in the antimicrobial activity of silver nanoparticles. 2026-06-17T00:00:00Z https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/9928 Síntesis y caracterización de benzofenazino dionas. Estudios de reactividad química y actividad anticancerígena Charcas Lara, Luis Abraham Las benzofenazinodionas han sido de gran interés por su versatilidad en áreas como óptica, electrónica, ciencia de materiales y farmacología; esta última por su amplio espectro de actividad biológica. La versatilidad farmacológica justifica la búsqueda de compuestos que puedan evaluarse como un primer acercamiento al desarrollo de fármacos para tratar un problema de salud pública como el cáncer. Se implementaron principios de química verde como el uso de solventes seguros, microondas y catalizadores para sintetizar seis moléculas de fenilaminonaftoquinona utilizadas como precursoras de cuatro compuestos de benzofenazinodionas con sustituyentes electrodonadores para analizar el efecto de estas variaciones estructurales. Los rendimientos oscilan porcentajes del 70-90% en el caso de las fenilaminonaftoquinonas y de 10-30% para las benzofenazinodionas, resultando en una síntesis favorable en la primera etapa, y optimizable en la segunda, derivado de la alta reactividad del nitreno generado en el medio de reacción. Se calcularon mediante química computacional orbitales moleculares y descriptor dual de Fukui con el método B3LYP/6-31+G(d, p) de las especies sintetizadas para comprender su reactividad, proponer mecanismo de síntesis y evaluar el potencial de utilizar estos compuestos en aplicaciones farmacológicas al intercalarse con ácido desoxirribonucleico (ADN), así como caracterizar un perfil fisicoquímico. Se propuso un mecanismo para ambas etapas de reacción, identificando zonas reactivas de procesos de adición-eliminación, formación de radicales y ciclación intramolecular. El acoplamiento molecular y perfil fisicoquímico comparados con un control de doxorrubicina proporciona energías de afinidad y propiedades comparables con la referencia en términos de estabilidad, permeabilidad, entre otras.; Benzophenazinediones have garnered significant interest due to their versatility in fields such as optics, electronics, materials science, and pharmacology—the latter owing to their broad spectrum of biological activity. Their pharmacological relevance justifies the search for novel compounds that may serve as a preliminary approach to drug development for addressing public health challenges, such as cancer. Green chemistry principles, including the use of benign solvents, microwave-assisted synthesis, and catalysis, were implemented to synthesize six phenylaminonaphthoquinone molecules. These were employed as precursors for four benzophenazinedione derivatives bearing electron-donating substituents to evaluate the influence of structural variations. Yields ranged from 70% to 90% for the phenylaminonaphthoquinones and 10% to 30% for the benzophenazinediones. These results indicate a favorable synthesis in the initial stage, while the second stage remains subject to optimization due to the high reactivity of the nitrene intermediate generated in situ. Computational chemistry was utilized to calculate molecular orbitals and Fukui dual descriptors at the B3LYP/6-31+G(d,p) level of theory to elucidate the reactivity of the synthesized species, propose reaction mechanisms, and assess the potential viability of these compounds as DNA intercalators. The proposed mechanisms identified key reactive sites for addition-elimination processes, radical formation, and intramolecular cyclization. Molecular docking and physicochemical profiling, compared against a doxorubicin control, yielded affinity energies and stability and permeability properties comparable to the reference standard. 2026-04-01T00:00:00Z https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/9925 Caracterización génica de Chlorella vulgaris para la biorremediación de aguas Gómez de la Torre, Alma Edith La biorremediación mediante el uso de microalgas representa una alternativa sostenible para el tratamiento de aguas contaminadas debido a su capacidad de asimilación de nitratos, fosfatos, amonio, materia orgánica e incluso metales pesados. En este contexto, el presente estudio tiene como objetivo caracterizar genéticamente a Chlorella vulgaris mediante datos de secuenciación masiva y anotación funcional del genoma para la selección de genes relacionados a la biorremediación. Se realizó un ensamblaje de novo y análisis funcional utilizando diversas herramientas bioinformáticas, incluyendo anotación con eggNOG-mapper y mapeo en KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). De acuerdo con los resultados, se obtuvo un ensamble a nivel contigs con un tamaño total de 143.33 Mb utilizando la herramienta Unicycler. Asimismo el análisis funcional reveló una alta proporción de proteínas hipotéticas, lo que sugiere la presencia de múltiples secuencias aún no caracterizadas. En contraste con lo anterior, la evaluación mediante COG (Clusters of Orthologous Groups) mostró una prevalencia de genes con función desconocida, junto con categorías relacionadas con metabolismo, transcripción y señalización, lo que refleja un genoma altamente regulado con la capacidad de adaptarse a diferentes condiciones ambientales. De manera complementaria, se identificaron genes asociados a la asimilación de metales pesados, fármacos y compuestos inorgánicos (como nitrógeno y fósforo), dentro de los que se incluyen transportadores, enzimas y proteínas asociadas al estrés ambiental. Finalmente, el análisis de rutas metabólicas confirmó la capacidad de C. vulgaris para transformar diversos contaminantes, evidenciando su potencial en aplicaciones de procesos biorremediación.; Bioremediation using microalgae represents a sustainable alternative for the treatment of contaminated water due to their ability to assimilate nitrates, phosphates, ammonium, organic matter, and even heavy metals. In this context, the present study aims to genetically characterize Chlorella vulgaris using high-throughput sequencing data and functional genome annotation for the identification of genes related to bioremediation. A de novo assembly and functional analysis were performed using various bioinformatics tools, including annotation with eggNOG-mapper and mapping in KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). According to the results, a contig-level assembly with a total size of 143.33 Mb was obtained using the Unicycler tool. Likewise, the functional analysis revealed a high proportion of hypothetical proteins, suggesting the presence of multiple sequences that are still not functionally characterized. In contrast, the evaluation using COG (Clusters of Orthologous Groups) showed a prevalence of genes with unknown function, along with categories related to metabolism, transcription, and signaling, reflecting a highly regulated genome capable of adapting to different environmental conditions. Additionally, genes associated with the assimilation of heavy metals, pharmaceuticals, and inorganic compounds (such as nitrogen and phosphorus) were identified, including transporters, enzymes, and proteins related to environmental stress. Finally, the analysis of metabolic pathways confirmed the ability of C. vulgaris to transform various contaminants, highlighting its potential in bioremediation processes. 2026-04-28T00:00:00Z