.Maestría en Ciencias en Bioprocesos.

Validación bioinformática y experimental de un antígeno recombinante contra el virus de la viruela símica

2026-10-19T17:12:42Z

Validación bioinformática y experimental de un antígeno recombinante contra el virus de la viruela símica Armendáriz Vázquez, Daniela a viruela símica (mpox), un Orthopoxvirus zoonótico emergente, ha cobrado relevancia internacional por su reemergencia y propagación fuera de las regiones endémicas, lo que pone de manifiesto su potencial epidémico. Aunque las vacunas basadas en el virus vaccinia atenuado han demostrado ser eficaces, su disponibilidad es limitada y la vacuna ideal debería formularse con antígenos específicos del virus de la viruela símica (MPXV) para ampliar la magnitud y la duración de la respuesta inmunitaria. En este contexto, las vacunas multiepitópicas representan una estrategia prometedora. En el presente estudio se diseñó y produjo en Escherichia coli una proteína quimérica denominada LTB-MPX, que incorpora epítopos de las proteínas A30L y E8L fusionados a la subunidad B de la enterotoxina termolábil de E. coli (LTB), utilizada como molécula acarreadora. La proteína LTB-MPX se expresó de manera eficiente y se recuperó a partir de cuerpos de inclusión mediante procedimientos convencionales de solubilización y renaturalización. Su inmunogenicidad se evaluó en un modelo murino, en el que fue capaz de inducir una respuesta humoral específica frente a la proteína viral E8L. En conjunto, estos resultados sientan las bases para optimizar el diseño de vacunas multiepitópicas dirigidas contra MPXV.; onkeypox (MPX), an emerging zoonotic orthopoxvirus, has gained international attention following its re-emergence and spread outside of endemic areas, highlighting its epidemic potential. While vaccines based on the attenuated vaccinia virus are considered effective, their availability is limited, and the ideal vaccine should be formulated with specific MPX antigens to improve the breadth and duration of the immune response. Considering that multiepitopic-vaccines represent a promising strategy, in this study a chimeric protein called LTB-MPX, which carries epitopes from the A30L and E8L proteins fused to the heat labile Escherichia coli enterotoxin B subunit as carrier, was designed and produced in E. coli. LTB-MPX was efficiently expressed and recovered from inclusion bodies under conventional solubilization and refolding steps. Immunogenicity of LTB MPX was assessed in test mice and it was able to induce specific humoral responses against the E8 viral target. This study sets the basis for optimizing the design of multiepitopic vaccines against MPX.

Desarrollo y evaluación de vehículos comestibles para el extracto natural de vainilla

2026-10-09T16:02:00Z

Desarrollo y evaluación de vehículos comestibles para el extracto natural de vainilla Bárcenas Manzanares, Mariana Se obtuvieron vehículos comestibles para el extracto natural de vainilla mediante la evaluación de dos metodologías de encapsulación: secado por aspersión y gelificación iónica. En el secado por aspersión se evaluaron cuatro factores experimentales: flujo de alimentación, temperatura de entrada, flujo de aire y la concentración de maltodextrina. La eficiencia de encapsulación (EE) de los tratamientos osciló entre 29.66 ± 0.09% - 69.95 ± 0.06%, mostrando una relación positiva con la concentración de maltodextrina y un efecto inverso con la temperatura de entrada. Las pruebas de actividad antioxidante alcanzaron valores óptimos de inhibición de inhibición ABTS de 92.75 ± 2.78% (0.120 mg/mL vainillina) y un IC50 de 0.02 mg/mL de vainillina, confirmando la preservación de compuestos fenólicos. Las microcápsulas presentaron fluidez aceptable (ángulo de reposo < 40°), densidades adecuadas, humedad de 3.94 ± 0.29 %, actividad de agua de 0.32 ± 0.03 y una temperatura de transición vítrea de 55.4 ± 0.58 °C, sugiriendo estabilidad al almacenamiento. En la gelificación iónica, se evaluaron concentración de alginato, dextrosa anhidra, y CaCl₂, y tiempo de residencia en la solución de reticulación. La EE alcanzó valores de 99.82- 99.95 ± 0.00%, la retención de líquido (RL) varió entre 41.36 ± 0.83% y 82.45 ± 0.46%, siendo la concentración de alginato el factor más determinante para ambas. Las perlas mostraron resistencia térmica hasta 60 °C, mientras que la textura instrumental indicó dureza (1278.8 ± 362 g), resiliencia (0.3 ± 0.0), fracturabilidad (195.3 ± 48.4 g) y adhesividad (87.7 ± 8.6) adecuadas para aplicaciones alimentarias.; Edible vehicles for natural vanilla extract were obtained through the evaluation of two encapsulation methodologies: spray drying and ionic gelation. In spray drying, four experimental factors were assessed: feed flow, inlet temperature, air flow, and maltodextrina concentration. The encapsulation efficiency (EE) of the treatments ranged from 29.66 ± 0.09% - 69.95 ± 0.06%, showing a positive relationship with maltodextrina concentration and an inverse effect with inlet temperature. Antioxidant activity test reached optimal ABTS inhibition values of 92.75 ± 2.78% (0.120 mg/mL vanillin) and an IC50 of 0.02 mg/mL vanillin, confirming the preservation of phenolic compounds. The microcapsules exhibited acceptable flowability (angle of repose <40°), adequate densities, moisture content of 3.94 0.29%, water activity of 0.32 ± 0.03, and a glass transition temperature of 55.4 ± 0.58°C, suggesting storage stability. In ionic gelation, alginate concentration, anhydrous dextrose, CaCl2 concentration, and residence time in the crosslinking solution were evaluated. EE values reached 99.82 - 99.95 ± 00.00%, while liquid retention (LR) varied between 41.36 ± 0.83% and 82.45 ± 0.46%, with alginate concentration being the most determinant factor for both responses. The beads showed thermal resistance up to 60°C, while instrumental texture analysis indicated hardness (1278.8 ± 362g), resilience (0.3 ± 0.0), fracturability (195.3 ± 48.4), and adhesiveness (87.7 ± 8.6) suitable for food applications.

Caracterización metagenómica de Chlorella vulgaris y Scenedesmus acutus para el estudio de rutas metabólicas interrelacionadas con bacterias

2026-08-31T15:12:06Z

Caracterización metagenómica de Chlorella vulgaris y Scenedesmus acutus para el estudio de rutas metabólicas interrelacionadas con bacterias Martínez Constantino, Abner Las interacciones entre microalgas y bacterias constituyen un componente fundamental de los ecosistemas acuáticos, ya que favorecen el intercambio de nutrientes, vitaminas y metabolitos que influyen en el crecimiento y la estabilidad de ambas comunidades. No obstante, los mecanismos metabólicos que sustentan estas asociaciones aún son poco comprendidos. En este trabajo se desarrolló una estrategia bioinformática integrativa para caracterizar el potencial funcional de bacterias asociadas a Chlorella vulgaris y Scenedesmus acutus mediante el análisis conjunto de datos metagenómicos y metatranscriptómicos. A partir del ensamblaje metagenómico se reconstruyeron genomas bacterianos ensamblados por metagenoma (MAGs) de alta calidad, los cuales fueron evaluados y anotados funcionalmente utilizando bases de datos especializadas. Posteriormente, se integró la información de expresión génica para construir matrices funcionales enfocadas en rutas metabólicas relacionadas con la comunicación e intercambio de metabolitos, incluyendo biosíntesis de biotina, riboflavina, sideróforos y mecanismos de percepción de quórum. Asimismo, se desarrollaron redes metabólicas que permitieron visualizar la distribución de funciones entre los MAGs e inferir posibles interacciones ecológicas. Como complemento, se implementó un modelo de aprendizaje automático basado en Random Forest para identificar las funciones metabólicas con mayor contribución a la importancia funcional de los MAGs dentro de la red, permitiendo priorizar procesos metabólicos potencialmente relevantes en la interacción microalga-bacteria. En conjunto, los resultados proporcionan un marco reproducible para explorar asociaciones microbianas mediante datos ómicos y aportan evidencia sobre los mecanismos metabólicos que podrían favorecer relaciones mutualistas con potencial aplicación en biotecnología y optimización de cultivos microalgales.; Microalgae-bacteria interactions are fundamental components of aquatic ecosystems, promoting the exchange of nutrients, vitamins, and metabolites that influence the growth and stability of both partners. However, the metabolic mechanisms underlying these associations remain poorly understood. This study presents an integrative bioinformatics framework to characterize the functional potential of bacterial communities associated with Chlorella vulgaris and Scenedesmus acutus through the combined analysis of metagenomic and metatranscriptomic data. Metagenomic assembly enabled the reconstruction of thirteen high-quality metagenome-assembled genomes (MAGs), which were subsequently assessed and functionally annotated using specialized databases. Gene expression data were integrated to generate functional matrices focused on metabolic pathways involved in microbial communication and metabolite exchange, including biotin biosynthesis, riboflavin production, siderophore metabolism, and quorum sensing. In addition, metabolic networks were constructed to visualize the distribution of these functions among MAGs and to infer potential ecological interactions. To complement these analyses, a Random Forest machine learning model was implemented to identify the metabolic functions that contributed most strongly to the functional importance of each MAG within the reconstructed network, enabling the prioritization of pathways potentially involved in microalgae-bacteria interactions. Overall, this work provides a reproducible computational framework for studying microbial associations using multi-omics data and offers new insights into the metabolic mechanisms that may promote mutualistic interactions, with potential applications in biotechnology, biomass production, and the optimization of microalgal cultivation systems.

Desarrollo y evaluación de una matriz congelada a base de proteínas sustentables: su impacto sobre las propiedades fisicoquímicas, sensoriales y funcionales

2026-09-09T15:40:14Z

Desarrollo y evaluación de una matriz congelada a base de proteínas sustentables: su impacto sobre las propiedades fisicoquímicas, sensoriales y funcionales González Pedraza, José Iván Se desarrollaron helados adicionados con harina de grillo, proteína aislada de haba, orujo de uva e inulina mediante un diseño central compuesto. Los factores evaluados fueron la cantidad total de mezcla proteica grillo–haba (A) y la proporción de harina de grillo dentro de dicha mezcla (B), complementada con proteína aislada de haba. Las formulaciones presentaron alto contenido de proteína (11.16–15.36%) y fibra (11.36–15.02%). La proporción de harina de grillo (B) influyó significativamente en el overrun (p < 0.05), observándose menores valores al aumentar su incorporación, mientras que la cantidad total de mezcla proteica (A) afectó principalmente la viscosidad y la temperatura de fusión (Tm). Los modelos de TPC y TEAC también fueron significativos (p < 0.05), con valores de 383.76–720.13 mg GAE/100 g y 8.97–15.59 µmol TE/g, respectivamente. En cuanto a las propiedades funcionales, la digestibilidad proteica in vitro se mantuvo estable entre formulaciones (76.17–78.42%). Las formulaciones también mostraron potencial prebiótico, evidenciado por el crecimiento de Lactiplantibacillus paraplantarum y la producción de ácidos grasos de cadena corta (AGCC) comparables con el control de inulina. En fibroblastos L929, los extractos no fueron citotóxicos, con viabilidades de 79.91–92.78%, ni promovieron un aumento significativo de especies reactivas de oxígeno intracelular (ROS). Sensorialmente, algunas muestras alcanzaron una aceptación moderada y mostraron perfiles cercanos al ideal en atributos como textura, granulosidad y regusto, por lo que el análisis JAR y de penalización pudo orientar ajustes futuros en sabor, dulzor y textura; Ice cream supplemented with cricket flour, faba bean protein isolate, grape pomace, and inulin were developed using a central composite design. The evaluated factors were the total amount of cricket–faba bean protein mixture (A) and the proportion of cricket flour within this mixture (B), complemented with faba bean protein isolate. The formulations presented high protein (11.16–15.36%) and fiber (11.36–15.02%) contents. The proportion of cricket flour (B) significantly influenced overrun (p < 0.05), with lower values observed as its incorporation increased, while the total amount of protein mixture (A) mainly affected viscosity and melting temperature (Tm). The TPC and TEAC models were also significant (p < 0.05), with values of 383.76–720.13 mg GAE/100 g and 8.97–15.59 µmol TE/g, respectively. Regarding functional properties, in vitro protein digestibility remained stable among formulations (76.17–78.42%). The formulations also showed prebiotic potential, evidenced by the growth of Lactiplantibacillus paraplantarum and the production of short-chain fatty acids (SCFAs) comparable to inulin control. In L929 fibroblasts, the extracts were not cytotoxic, with viabilities of 79.91–92.78%, nor did they promote a significant increase in intracellular reactive oxygen species (ROS). Sensorially, some samples reached moderate acceptance and showed profiles close to the ideal in attributes such as texture, graininess, and aftertaste, so the JAR and penalty analysis could guide future adjustments in flavor, sweetness, and texture.