https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/5034 2026-05-01T18:43:18Z 2026-05-01T18:43:18Z Charcas Lara, Luis Abraham https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/9928 2026-04-30T18:41:08Z 2026-04-01T00:00:00Z

Síntesis y caracterización de benzofenazino dionas. Estudios de reactividad química y actividad anticancerígena Charcas Lara, Luis Abraham Las benzofenazinodionas han sido de gran interés por su versatilidad en áreas como óptica, electrónica, ciencia de materiales y farmacología; esta última por su amplio espectro de actividad biológica. La versatilidad farmacológica justifica la búsqueda de compuestos que puedan evaluarse como un primer acercamiento al desarrollo de fármacos para tratar un problema de salud pública como el cáncer. Se implementaron principios de química verde como el uso de solventes seguros, microondas y catalizadores para sintetizar seis moléculas de fenilaminonaftoquinona utilizadas como precursoras de cuatro compuestos de benzofenazinodionas con sustituyentes electrodonadores para analizar el efecto de estas variaciones estructurales. Los rendimientos oscilan porcentajes del 70-90% en el caso de las fenilaminonaftoquinonas y de 10-30% para las benzofenazinodionas, resultando en una síntesis favorable en la primera etapa, y optimizable en la segunda, derivado de la alta reactividad del nitreno generado en el medio de reacción. Se calcularon mediante química computacional orbitales moleculares y descriptor dual de Fukui con el método B3LYP/6-31+G(d, p) de las especies sintetizadas para comprender su reactividad, proponer mecanismo de síntesis y evaluar el potencial de utilizar estos compuestos en aplicaciones farmacológicas al intercalarse con ácido desoxirribonucleico (ADN), así como caracterizar un perfil fisicoquímico. Se propuso un mecanismo para ambas etapas de reacción, identificando zonas reactivas de procesos de adición-eliminación, formación de radicales y ciclación intramolecular. El acoplamiento molecular y perfil fisicoquímico comparados con un control de doxorrubicina proporciona energías de afinidad y propiedades comparables con la referencia en términos de estabilidad, permeabilidad, entre otras.; Benzophenazinediones have garnered significant interest due to their versatility in fields such as optics, electronics, materials science, and pharmacology—the latter owing to their broad spectrum of biological activity. Their pharmacological relevance justifies the search for novel compounds that may serve as a preliminary approach to drug development for addressing public health challenges, such as cancer. Green chemistry principles, including the use of benign solvents, microwave-assisted synthesis, and catalysis, were implemented to synthesize six phenylaminonaphthoquinone molecules. These were employed as precursors for four benzophenazinedione derivatives bearing electron-donating substituents to evaluate the influence of structural variations. Yields ranged from 70% to 90% for the phenylaminonaphthoquinones and 10% to 30% for the benzophenazinediones. These results indicate a favorable synthesis in the initial stage, while the second stage remains subject to optimization due to the high reactivity of the nitrene intermediate generated in situ. Computational chemistry was utilized to calculate molecular orbitals and Fukui dual descriptors at the B3LYP/6-31+G(d,p) level of theory to elucidate the reactivity of the synthesized species, propose reaction mechanisms, and assess the potential viability of these compounds as DNA intercalators. The proposed mechanisms identified key reactive sites for addition-elimination processes, radical formation, and intramolecular cyclization. Molecular docking and physicochemical profiling, compared against a doxorubicin control, yielded affinity energies and stability and permeability properties comparable to the reference standard.

2026-04-01T00:00:00Z Gómez de la Torre, Alma Edith https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/9925 2026-04-28T15:03:29Z 2026-04-28T00:00:00Z

Caracterización génica de Chlorella vulgaris para la biorremediación de aguas Gómez de la Torre, Alma Edith La biorremediación mediante el uso de microalgas representa una alternativa sostenible para el tratamiento de aguas contaminadas debido a su capacidad de asimilación de nitratos, fosfatos, amonio, materia orgánica e incluso metales pesados. En este contexto, el presente estudio tiene como objetivo caracterizar genéticamente a Chlorella vulgaris mediante datos de secuenciación masiva y anotación funcional del genoma para la selección de genes relacionados a la biorremediación. Se realizó un ensamblaje de novo y análisis funcional utilizando diversas herramientas bioinformáticas, incluyendo anotación con eggNOG-mapper y mapeo en KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). De acuerdo con los resultados, se obtuvo un ensamble a nivel contigs con un tamaño total de 143.33 Mb utilizando la herramienta Unicycler. Asimismo el análisis funcional reveló una alta proporción de proteínas hipotéticas, lo que sugiere la presencia de múltiples secuencias aún no caracterizadas. En contraste con lo anterior, la evaluación mediante COG (Clusters of Orthologous Groups) mostró una prevalencia de genes con función desconocida, junto con categorías relacionadas con metabolismo, transcripción y señalización, lo que refleja un genoma altamente regulado con la capacidad de adaptarse a diferentes condiciones ambientales. De manera complementaria, se identificaron genes asociados a la asimilación de metales pesados, fármacos y compuestos inorgánicos (como nitrógeno y fósforo), dentro de los que se incluyen transportadores, enzimas y proteínas asociadas al estrés ambiental. Finalmente, el análisis de rutas metabólicas confirmó la capacidad de C. vulgaris para transformar diversos contaminantes, evidenciando su potencial en aplicaciones de procesos biorremediación.; Bioremediation using microalgae represents a sustainable alternative for the treatment of contaminated water due to their ability to assimilate nitrates, phosphates, ammonium, organic matter, and even heavy metals. In this context, the present study aims to genetically characterize Chlorella vulgaris using high-throughput sequencing data and functional genome annotation for the identification of genes related to bioremediation. A de novo assembly and functional analysis were performed using various bioinformatics tools, including annotation with eggNOG-mapper and mapping in KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). According to the results, a contig-level assembly with a total size of 143.33 Mb was obtained using the Unicycler tool. Likewise, the functional analysis revealed a high proportion of hypothetical proteins, suggesting the presence of multiple sequences that are still not functionally characterized. In contrast, the evaluation using COG (Clusters of Orthologous Groups) showed a prevalence of genes with unknown function, along with categories related to metabolism, transcription, and signaling, reflecting a highly regulated genome capable of adapting to different environmental conditions. Additionally, genes associated with the assimilation of heavy metals, pharmaceuticals, and inorganic compounds (such as nitrogen and phosphorus) were identified, including transporters, enzymes, and proteins related to environmental stress. Finally, the analysis of metabolic pathways confirmed the ability of C. vulgaris to transform various contaminants, highlighting its potential in bioremediation processes.

2026-04-28T00:00:00Z Espinoza López, Byanka Sthefany https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/9919 2026-04-22T19:10:57Z 2026-04-24T00:00:00Z

Análisis de la participación del RNA largo intergénico no codificante TALIR, en el desarrollo y durante el estrés por déficit hídrico en Arabidopsis thaliana Espinoza López, Byanka Sthefany El desarrollo vegetal es un proceso fisiológico complejo regulado por numerosas proteínas, factores de transcripción y señales ambientales. En este contexto, los RNAs largos no codificantes (lncRNAs) han emergido como moduladores clave del crecimiento y la respuesta al estrés. Los lncRNAs son transcritos de longitud mayor a 200 nucleótidos de baja o ninguna capacidad codificante que regulan la expresión génica mediante interacciones con DNA, proteínas y otros RNAs. Sin embargo, a pesar de sus funciones relevantes, solo un número limitado de lncRNAs ha sido caracterizado en plantas. En este estudio se describe, a nivel genómico y fenotípico, el lncRNA TALIR, localizado en la región intergénica entre TATA-binding protein 2 (TBP2) y el gen que codifica para una ubiquitina ligasa E3 RINGU en Arabidopsis thaliana. Las plantas mutantes de TALIR mostraron hojas y rosetas de menor tamaño, así como una disminución en la densidad de raíces laterales. Además las líneas mutantes de TALIR presentan niveles alterados de la abundancia relativa de TBP2, lo que conduce a una desregulación de la expresión del MIR396 y GRF2, así como de MIR156 y SPL9, sugiriendo que estas desregulaciones podrían contribuir a la variación del tamaño de las hojas. Por otro lado, el estrés abiótico es una de las principales causas de pérdida de cultivos a nivel global, por lo que se investigó si TALIR está involucrado en la respuesta al estrés hídrico. TALIR se acumula en tratamientos con ABA y NaCl en plantas WT, mientras que las mutantes de TALIR exhiben insensibilidad a ABA durante la germinación, lo que sugiere un posible papel de TALIR en este proceso. En conjunto, estos resultados expanden el conocimiento actual sobre los lncRNAs en el desarrollo y la respuesta al estrés abiótico y aporta nuevos hallazgos del control de la regulación mediada por MIRNAs.; Plant development is a complex physiological process regulated by numerous proteins, transcription factors, and environmental signals. In this context, long non-coding RNAs (lncRNAs) have emerged as important modulators of plant growth, development and stress responses. LncRNAs are transcripts longer than 200 nucleotides with little or no protein-coding capacity that regulate gene expression through interactions with DNA, proteins, and other RNAs. However, despite their important regulatory roles, only a limited number of them have been characterized in plants. In this study, we describe the genetic and phenotypic characterization of the TBP2-associated long intergenic non-coding RNA (TALIR) encoded upstream of TATA-binding protein 2 (TBP2) and downstream of the ubiquitin ligase gene E3 RINGU of Arabidopsis thaliana. Talir mutant plants exhibited smaller leaves and rosette size, as well as reduced lateral root density. Additionally, talir mutant lines displayed altered relative levels of TBP2, leading to the deregulation of MIR396 and GRF2, as well as MIR156 and SPL9 expression, suggesting that these alterations may in part contribute to the altered leaf size observed. Furthermore, abiotic stress is one of the main causes of crop losses worldwide. Therefore, we investigated whether TALIR is involved in water-deficit stress responses. TALIR is upregulated upon ABA and NaCl treatments in WT plants, whereas talir mutants exhibit ABA insensitivity during germination, suggesting a potential role for TALIR in plant development and abiotic stress responses. Together, these results widen our current understanding on the roles of lncRNAs in plant development and stress responses and provide new insights into miRNA-mediated regulatory mechanisms.

2026-04-24T00:00:00Z Rodríguez Aquino, Edgar de Jesús https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/9917 2026-04-22T14:56:57Z 2026-04-21T00:00:00Z

Dosificación de Precisión de Ácido Micofenólico a partir de un modelo farmacocinético poblacional en pacientes con nefritis lúpica Rodríguez Aquino, Edgar de Jesús El Micofenolato de mofetilo (MMF) profármaco del Ácido Micofenólico (MPA), es un fármaco inmunosupresor utilizado para tratar la nefritis lúpica (NL), una de las complicaciones más importantes en los pacientes con lupus eritematoso sistémico. Sin embargo, el tratamiento con este fármaco se caracteriza por una alta variabilidad farmacocinética interindividual. Entre los factores que contribuyen a esta variabilidad se encuentran la disfunción renal y la hipoalbuminemia, los cuales se asocian con niveles plasmáticos más bajos de MPA provocando una mala respuesta al tratamiento. Se ha demostrado previamente que la aplicación de regímenes de dosificación diseñados a partir de modelos poblacionales que consideren las características individuales de cada uno de los pacientes disminuye considerablemente la variabilidad farmacocinética del MPA, aumentado la probabilidad de alcanzar el objetivo terapéutico. En este trabajo, se realizó la dosificación de precisión de MMF a partir de estimación bayesiana para evaluar la respuesta al tratamiento farmacológico. Para lo anterior, se optimizó y validó un método por UPLC-MS/MS para la cuantificación de MPA en plasma y se estableció una estrategia de muestreo limitado considerando la concentración plasmática pre-dosis y 2 horas post-dosis, para estimar el ABC0-12h mediante simulaciones estocásticas. Se realizó un estudio clínico piloto en 30 pacientes con NL para cuantificar las concentraciones plasmáticas de MPA y se observó una amplia variabilidad interindividual en la exposición al MPA, con una proporción importante fuera del rango terapéutico, especialmente en aquellos con enfermedad activa. La individualización de la dosis de MMF, basada en un modelo farmacocinético poblacional de MPA, permitió proponer ajustes de dosificación personalizados. Además, durante el seguimiento clínico de un subgrupo de pacientes, la reducción significativa de la dosis y concentraciones plasmáticas se asoció con un aumento en el aclaramiento de creatinina, lo que respalda la utilidad clínica de la cuantificación de los niveles plasmáticos de MPA.; Mycophenolate mofetil (MMF), a prodrug of mycophenolic acid (MPA), is an immunosuppressive agent widely used in the treatment of lupus nephritis (LN), one of the most significant complications in patients with systemic lupus erythematosus. However, therapy with this drug is characterized by substantial interindividual pharmacokinetic variability. Among the factors contributing to this variability are renal disfunction and hypoalbuminemia, both of which are associated with lower plasma concentrations of MPA and, consequently a poorer therapeutic response. It has been previously demonstrated tant applying dosing regimens designed from population models that consider the individual characteristics of each patient considerably reduces the pharmacokinetic variability of MPA, ensuring the therapeutic target. In this study, precision dosing of MMF was performed using Bayesian estimation to evaluate the response to pharmacological treatment. A UPLC-MS/MS method for quantifying MPA in plasma was optimized and validated. Additionally, a limited sampling strategy was established, incorporating pre-dose and 2-hour post-dose plasma concentrations to estimate AUC0-12h through stochastic simulations. A pilot clinical study was conducted in 30 patients with LN to quantify plasma concentrations of MPA. A wide interindividual variability in MPA exposure was observed, with a significant proportion outside the therapeutic range, especially in those with active diseases. Individualization of the MMF dose based on population model of MPA, enabled the proposal of personalized dosing adjustments. Furthermore, during the clinical follow-up of a subgroup of patients, a significant reduction in dose and plasma concentrations was associated with an increase in creatinine clearance, supporting the clinical utility of monitoring plasma MPA levels.

2026-04-21T00:00:00Z